科学家绘制出人类基因高分辨率三维图谱
来源:国际在线 作者:未知 2009年10月11日
一些细胞生物学家此前提出,基因的压缩并不仅仅是一个有效的存储机制,这种组成方式和基因功能以及基因之间的相互作用也有关联。但是,因为基因组测序实验会破坏基因的形状,电子显微镜也无法观测基因压缩的具体情况,因此这方面的研究一直没有获得突破。
今年四月份,美国国家科学院院刊刊登了《基因在染色体中的活动模式和其物理距离之间的联系》,这篇文章提供了基因形状的说服性证据和数据,并绘制出低分辨率图像。而目前这张刊登在10月7日科学杂志上的高分辨率图像,则更详尽的提供了基因排列形状的细节。德科尔说:“这张基因的三维高分辨率图谱可以改变人们研究染色体的方法。我们可以通过它和基因的活动相联系,探寻细胞结构的变化情况。”
据报道,为了确定基因的结构,科学家首先将细胞核浸泡在甲醛中,甲醛可以像胶水一样连接靠在一起的基因,保持基因在三维空间里的真实情况。接着科学家用化学的方法打破基因之间的联系,只让相互靠近的基因保持连接,形成成对的基因碎片。在电脑软件的帮助下,按照基因原来的排列顺序重塑基因之间的联系。这样,就成功的绘制出这张高分辨率的基因三维图谱。
另一参加图谱绘制的科学家哈佛大学计算机生物学家埃雷兹·里伯曼·艾登(Erez Lieberman-Aiden)说:“这个重塑出来的基因模型中没有节点,就像是一团压缩在一起的面条。但是,你可以在不破坏其结构的情况下,任意的抽取其中的一部分,并可以将其恢复原样。”
今年四月份,美国国家科学院院刊刊登了《基因在染色体中的活动模式和其物理距离之间的联系》,这篇文章提供了基因形状的说服性证据和数据,并绘制出低分辨率图像。而目前这张刊登在10月7日科学杂志上的高分辨率图像,则更详尽的提供了基因排列形状的细节。德科尔说:“这张基因的三维高分辨率图谱可以改变人们研究染色体的方法。我们可以通过它和基因的活动相联系,探寻细胞结构的变化情况。”
据报道,为了确定基因的结构,科学家首先将细胞核浸泡在甲醛中,甲醛可以像胶水一样连接靠在一起的基因,保持基因在三维空间里的真实情况。接着科学家用化学的方法打破基因之间的联系,只让相互靠近的基因保持连接,形成成对的基因碎片。在电脑软件的帮助下,按照基因原来的排列顺序重塑基因之间的联系。这样,就成功的绘制出这张高分辨率的基因三维图谱。
另一参加图谱绘制的科学家哈佛大学计算机生物学家埃雷兹·里伯曼·艾登(Erez Lieberman-Aiden)说:“这个重塑出来的基因模型中没有节点,就像是一团压缩在一起的面条。但是,你可以在不破坏其结构的情况下,任意的抽取其中的一部分,并可以将其恢复原样。”
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